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MS软件模块翻译-分析GULP结果显示轨迹和图表数据

来源:哔哩哔哩 发布日期:2023-06-13 17:08:32 分享到:

当作业已完成并且所有输出文件已成功下载到合适的结果文件夹时,可以开始分析GULP结果。

注意:从通过网关在服务器上运行的已完成GULP作业成功下载输出文件后,结构和/或力场库将自动更新,同时创建轨迹文件(如果适用)。对于在独立模式下运行的作业,这种情况不会自动发生。所有其他分析功能必须使用GULP分析对话框上的控件手动执行。


(相关资料图)

显示轨迹和图表数据

根据执行的计算类型,GULP运行可能会生成轨迹文档和一个或多个图表文档。这些文档彼此之间有着特殊的关联,因为图上的每个点都对应于轨迹中的一个帧。

无论何时运行几何优化或动力学计算,GULP都会生成轨迹(.xtd)文件。在所有情况下,优化的历史记录都会在一个名为[seedname(计算命名时的文件名)].xtd的文件中返回。

当您运行几何优化时,会生成两个图表文档:

l [seedname]Energies.xcd-包含总能量与优化步骤的关系图

l [seedname]Convergence.xcd-包括以对数尺度显示,总能量变化和梯度与优化步骤的关系(还显示了几何优化运行的收敛标准)

当你运行分子动力学模拟时,会生成三个或四个图表文件(取决于模型的维度):

l [seedname]Constant.xcd-包含运动常数与模拟时间的关系图。

l 运动常数的性质取决于所使用的系综,在最简单的NVE情况下,它只是总能量。更复杂的组合将恒温器和气压计的贡献添加到总能量中,以构成运动常数。

l [seedname]Energy.xcd-包含动能和势能与模拟时间的关系图

l [seedname]Temperature.xcd-包含温度与模拟时间之间的关系图

l [seedname]Pressure.xcd-包括压力与模拟时间之关系图(仅适用于3D周期性结构)

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